Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
DUSP4Q13115 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms