Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RN7SL653P-201ENST00000494134 293 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 LINC01927-201ENST00000582231 712 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01002-216ENST00000632351 572 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SIRT5-201ENST00000359782 3797 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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MKRN3Q13064 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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MKRN3Q13064 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 LINC01170-201ENST00000519703 406 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
MKRN3Q13064 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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