Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BPTFQ12830 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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