Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms