Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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