Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms