Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
C16orf54Q6UWD8 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms