Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TDRD12Q587J7 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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