Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PART1-201ENST00000504876 5616 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZAN-204ENST00000546292 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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