Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
NFIXQ14938 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NFIXQ14938 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms