Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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