Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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