Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4AQ13619 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms