Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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