Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
TCOF1Q13428 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
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TCOF1Q13428 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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TCOF1Q13428 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
TCOF1Q13428 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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