Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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TRAF1Q13077 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRAF1Q13077 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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