Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CTDSPL2Q05D32 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms