Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CENPFP49454 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CENPFP49454 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CENPFP49454 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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