Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
ERVV-1B6SEH8 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms