Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC140658.6-201ENST00000603958 201 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 UPP2-201ENST00000005756 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC243960.3-201ENST00000599316 580 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC008626.1-201ENST00000604384 255 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRIM35Q9UPQ4 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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