Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CCDC88CQ9P219 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms