Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRHQ9HD43 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.3 ms