Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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CLIP4Q8N3C7 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLIP4Q8N3C7 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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