Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLC12A1-203ENST00000396577 4708 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ATP1A2-201ENST00000361216 5421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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LAMA3Q16787 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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LAMA3Q16787 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 GON4L-202ENST00000361040 5118 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 MYH13-201ENST00000252172 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
LAMA3Q16787 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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