Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms