Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CACNA1SQ13698 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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