Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PICALMQ13492 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PICALMQ13492 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms