Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MEPE-201ENST00000361056 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms