Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
ITGB3BPQ13352 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms