Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPN13Q12923 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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