Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ACADSBP45954 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms