Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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SCN4AP35499 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN4AP35499 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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