Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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RFXAPO00287 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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