Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LMCD1-AS1-203ENST00000441861 2683 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP26-201ENST00000410247 293 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CLEC1A-203ENST00000420265 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TUG1_3.1-201ENST00000616187 237 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DCX-201ENST00000356220 3019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PAPD4-202ENST00000423041 3223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CYP39A1-201ENST00000275016 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TAAR8-201ENST00000275200 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CSE1L-AS1-201ENST00000417781 556 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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