Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms