Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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C8orf49Q96NF6 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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C8orf49Q96NF6 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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C8orf49Q96NF6 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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C8orf49Q96NF6 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC098850.2-201ENST00000578710 686 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
C8orf49Q96NF6 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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