Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms