Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
COL4A6Q14031 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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COL4A6Q14031 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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COL4A6Q14031 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
COL4A6Q14031 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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