Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC016747.1-201ENST00000420918 2532 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 S100A13-202ENST00000392622 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
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