Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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CDH18Q13634 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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