Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LINC01796-201ENST00000611915 709 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC108477.1-201ENST00000636764 526 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DKK2-201ENST00000285311 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SNW1-201ENST00000261531 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TYW1B-202ENST00000612372 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZNF714-210ENST00000620627 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SLC17A6-201ENST00000263160 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TMEM161B-205ENST00000506536 2328 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ABRAXAS1-206ENST00000506553 1869 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 WDR92-202ENST00000406245 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC074043.1-201ENST00000483126 1776 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RAB19-201ENST00000356407 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 FRG1JP-201ENST00000376334 931 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 GZMB-203ENST00000382542 666 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 FYTTD1P1-201ENST00000424250 921 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LINC01865-201ENST00000430529 845 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SNX18P2-201ENST00000438540 808 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL590867.2-201ENST00000492974 447 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MTND6P17-201ENST00000511811 519 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RAB19-203ENST00000537763 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC093330.1-204ENST00000582763 396 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RNF219-AS1-213ENST00000607860 577 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 GZMB-209ENST00000616551 559 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RBMS3-AS2-207ENST00000629416 456 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CARD8-216ENST00000520153 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RPL32-204ENST00000429711 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CHRNA6-205ENST00000534622 1872 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZSCAN30-201ENST00000333206 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ANKRD20A21P-202ENST00000623715 3588 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms