Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC119868.1-201ENST00000579307 336 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RN7SL539P-201ENST00000610974 291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RN7SL196P-201ENST00000614361 291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 JPX_1.1-201ENST00000614715 135 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RN7SL286P-201ENST00000616519 291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL158077.1-201ENST00000616744 174 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZNF184-201ENST00000211936 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PASD1-201ENST00000370357 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 DLGAP1-AS5-202ENST00000565811 2594 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZBTB14-201ENST00000357006 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PNPLA1-202ENST00000388715 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MAGEB16-202ENST00000399987 1736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MAGEB16-205ENST00000399992 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 TCF4-254ENST00000626584 1701 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL356235.1-201ENST00000602791 2363 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 TMEM254-AS1-201ENST00000412298 3121 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 IBSP-201ENST00000226284 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PSEN1-204ENST00000394164 3046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 FGFR2-209ENST00000369056 2650 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 FGF11-203ENST00000575082 2315 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZNF221-204ENST00000592350 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SH2D4A-204ENST00000519207 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR370-201ENST00000362135 75 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RN7SKP231-201ENST00000363281 277 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PRRG3-202ENST00000370354 650 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SPINK4-202ENST00000379725 533 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 GAPDHP72-201ENST00000402643 1010 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL627402.1-201ENST00000405276 735 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL135924.2-201ENST00000427901 361 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL133387.3-201ENST00000450669 522 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ACAP1-209ENST00000575415 317 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 FXYD3-213ENST00000605552 837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR6511A2-201ENST00000611011 67 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR6511A3-201ENST00000615389 67 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR6511A4-201ENST00000615860 67 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MIR6511A1-201ENST00000617664 67 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 OR55B1P-202ENST00000641245 1276 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 DMGDH-201ENST00000255189 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ERICH6B-201ENST00000298738 2421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 BBS4-202ENST00000395205 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC005776.2-201ENST00000609708 1769 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 ZNF830-201ENST00000361952 2246 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 FBXO48-201ENST00000377957 5666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 EPB41L5-204ENST00000443902 3167 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CACNB1Q02641 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms