Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FAM3AP98173 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms