Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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PTPRFP10586 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRFP10586 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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