Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CTBP2P1-201ENST00000431853 245 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC108724.2-201ENST00000634593 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 SHQ1-203ENST00000463369 2065 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF333-201ENST00000292530 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OR6N2-201ENST00000339258 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 EEF1AKMT1-202ENST00000382758 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TRIM35Q9UPQ4 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TRIM35Q9UPQ4 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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TRIM35Q9UPQ4 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AOAH-208ENST00000612871 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ALDH6A1-202ENST00000553458 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AL365475.1-201ENST00000565135 1949 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 WASF4P-201ENST00000444248 1494 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 AKAP3-206ENST00000545990 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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