Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms