Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
APOBEC3GQ9HC16 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3GQ9HC16 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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