Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RTCA-AS1-201ENST00000421185 423 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 TUBB4BP2-201ENST00000454125 798 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 CHIAP1-201ENST00000456220 995 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 DKK2-204ENST00000513208 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 HLA-B-257ENST00000640094 147 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 DHRS9-202ENST00000412271 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PHACTR1Q9C0D0 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms