Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
COL24A1Q17RW2 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
COL24A1Q17RW2 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms