Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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CCDC142Q17RM4 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC142Q17RM4 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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